由於免疫系統功能低下，感染了艾滋病病毒的人難以抵抗傳染病和惡性腫瘤，這被稱作“機會性感染”，因為這些感染利用了脆弱的免疫系統提供的機會。
下表中是部分全球最常見的與艾滋病相關的機會性感染和疾病，包括：
-諸如肺結核、鳥複合分支桿菌、細菌性肺炎和敗血病(血中毒)之類的細菌性疾病;
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-如卡氏肺囊蟲肺炎(PCP)、弓形體病、微孢子蟲病、隱孢子蟲病、牛皮癬和利什曼病等原蟲性疾病;
-真菌性疾病如念珠菌病、隱球菌病和馬爾尼菲青黴病等;
-由鉅細胞病毒、單純皰疹、帶狀皰疹等引起的病毒類疾病;
-艾滋病病毒相關的腫瘤如卡波氏肉瘤、淋巴瘤和扁平細胞癌。
在艾滋病不同的階段會出現不同典型症狀。在艾滋病早期，人們會患結核、瘧疾、細菌性肺炎、皰疹、葡萄球菌皮膚感染和白血病。這是人們即使在擁有正常的免疫系統下也會患的疾病，但是由於艾滋病病毒的緣故，在他們中發生的比率會更高，並且與有健康的免疫系統的人相比，艾滋病攜帶者恢復的時間會更長。
當免疫系統由於之前感染的艾滋病病毒或者艾滋病變得功能低下時，就會患上如卡式肺囊蟲肺炎、弓形體病、隱球菌病等機會性感染。一些感染會擴散到一些不同的器官中去，這種現象被稱作“發散性”或“系統性”疾病。在最後階段出現的許多機會性感染可能是致命的。
那麼為什麼還要預防和治療機會性感染呢?
抗逆轉錄病毒聯合治療可以減少一個人體內艾滋病病毒的數量並且重建其免疫系統。抗逆轉錄病毒聯合治療的引入已經大幅度降低服藥的感染者發生機會性感染機會，但是對於機會性感染的預防和治療仍然是必要的。
世界上資源匱乏的地區，尚有數百萬艾滋病感染者接受不到抗逆轉錄病毒聯合治療。甚至在一些可以獲得藥物的地區，也不能更早滿足他們治療和預防機會性感染的需求。有時候建議對急性感染期的感染者採取抗逆轉錄聯合治療，尤其是如果這種感染很難治療。然而在某些情況下，延遲抗逆轉錄聯合治療開始的時間更好，而是僅僅對機會性感染進行治療，尤其是在涉及到藥物相互作用或積累藥物毒素的時候。
已經開始服用抗逆轉錄病毒藥物的人在這種情況下可能需要其它的藥物。特別是有一些機會性感染會在開始採用抗逆轉錄病毒聯合治療之後因為免疫系統的恢復而很快好轉，這就需要特殊的治療。如果抗逆轉錄病毒藥物因為依從性不好或者是抗藥性及其他原因而失效的話，預防和治療機會性感染的措施就會變得非常必要。
預防和治療機會性感染不僅可以幫助感染者能夠存活更長的時間，而且還可以幫助預防結核病及其它有傳染性的機會性感染傳播給其它人。
預防與艾滋病相關的機會性感染?
艾滋病感染者可以減少他們對一些威脅他們健康的病毒的暴露。他們應當尤其注意未經加工的肉類、家禽、人類排洩物、湖水或河水。當然對於導致念珠菌病、鳥分支桿菌病、細菌性肺炎等疾病的細菌減少暴露沒有有效的方法，因為它們普遍存在在環境之中。
幾種與艾滋病病毒有關的感染(包括肺結核、細菌性肺炎、瘧疾、白血病和卡式肺囊蟲肺炎)可以通過藥物預防。這就是眾所周知的藥物預防。有一種藥物叫做複方新諾明(也稱為septra, bactrim和TMP-SMX)，對於預防多種機會性感染非常有效。這種藥物便宜而且易獲得。世界衛生組織(WHO)推薦，在資源匱乏地區的下列人群應當開始使用複方新諾明：
-暴露於艾滋病病毒的嬰兒和兒童，在出生4-6周之後可以開始使用，或在開始時與衛生保健結合起來，一直到艾滋病感染的可能性排除之後。
-一週歲以下的感染艾滋病病毒的兒童。
-1-4歲感染艾滋病病毒的兒童，有輕微、中度和嚴重的艾滋病症狀，或者CD4計數低於25%。
-感染艾滋病病毒的成人和青少年，有輕微、中度和嚴重的艾滋病症狀，或者CD4細胞計數低於每毫升350個。
-針對卡式肺囊蟲肺炎進行過治療的艾滋病病毒感染者。
-根據世界衛生組織的指導原則，對於艾滋病病毒感染者的治療應該持續到孩子5歲，而且總體來說應該是一直持續的，不過可能在中間因為成功的抗逆轉錄病毒治療而停止。
在一些感染最嚴重的國家會選擇給所有母親確認或懷疑感染艾滋病病毒的的嬰兒和兒童治療，直到艾滋病病毒感染的可能性被排除。他們也會選擇治療所有確診艾滋病病毒感染的人，不論是否有症狀或者CD4計數情況。
藥物預防有時也會在已經開始使用抗逆轉錄病毒聯合治療的人中被推薦，如果他們的免疫系統很脆弱或者被認定是特別脆弱。建議他們在免疫系統恢復之後停止服用這種藥物。
對於已經發生機會性感染或者正在進行有效的治療的人，建議進行二級預防以防止復發。這適用於結核病、沙門氏菌、鉅細胞和卡式肺囊蟲肺炎。
與艾滋病相關的機會性感染的治療
有一些機會性感染比別的更容易治療。有效的治療依靠健康服務，這種服務能夠獲得、儲存和管理必要的藥物並且提供相關的治療、關懷和診斷服務，以監督健康狀況和治療反應。
一些機會性感染如口腔、咽喉或陰道(鵝口瘡)的念珠菌病、皰疹(帶狀皰疹)和單純皰疹之類的症狀可以通過家庭護理得到有效的處理。在家庭護理的情況下，可通過觀察到症狀來做出診斷。
在衛生基礎設施差的地方，一些機會性感染要依靠觀察或者顯微鏡才能診斷、治療。這些感染包括肺結核和隱球菌腦膜炎。
在較大的衛生機構中，可方便獲得的包括X光設備和細菌培養設備，這些設備可診斷和治療如肺以外的肺結核、鉅細胞感染、牛皮癬、卡式肺囊蟲肺炎和卡波西肉瘤之類的機會性感染。
在先進的醫療機構中，弓形體病、鳥分支桿菌和鉅細胞感染之類的機會性感染都可以被診斷和治療。而治療這些感染在資源匱乏的國家幾乎是不可能的。許多發展中國家缺少治療這些更復雜的感染的所需要的先進設備和醫療體系(如CT機)。