根據它發病原因，一般可以分為三種：血源性骨髓炎、外傷性骨髓炎、鄰近組織的感染蔓延至骨骼而發生的骨髓炎。
臨床上可分為以下五大類：
骨髓炎的原因有以下幾種；
1、硬化性骨髓炎：硬化性骨髓炎表現為一段骨幹或整個骨幹的進行性、廣泛性增生和硬化的炎性改變。因炎性反應的刺激，導致骨髓腔內發生廣泛纖維化、甚至骨髓腔消失，血液循環發生障礙，有竇道形成等。
2、急性血源性骨髓炎：急性血源性骨髓炎是化膿菌由身體其它部位的感染灶進入血流傳播並定位於骨組織而引起的炎症。它的病理特點是骨質破壞、壞死和反應性骨質增生同時存在。80%以上是由金黃色葡萄球菌引起的。
3、慢性化膿性骨髓炎：慢性化膿性骨髓炎一般是由於急性血源性骨髓炎治療不當或延誤治療而發生的結果。它有典型的急性血源性骨髓炎的病史，死骨、死腔、竇道的形成。
4、外傷性化膿性骨髓炎：外傷性化膿性骨髓炎常繼發於開發性骨折，隨著現在的交通事故和大型建築的工傷事件的發生，呈上升趨勢，屬高能量骨折後的常見併發症。其特點是，感染的病灶始終以骨折部位為中心，向兩端發展蔓延，同時多在骨折部位形成死腔。而在其骨與軟組織形成膿腫，常反覆破潰，成為長期不愈的竇道。這也是慢性骨髓炎開始的標誌。
5、醫源性骨髓炎：醫源性骨髓炎大多發生於手術中，由於醫務人員過分依賴抗生素而放鬆無菌操作，使患者的抵抗能力低下，招致了細菌的侵犯。複雜大手術的實施，使患部有機會接觸細菌，而抗生素的不正確使用和不及時有效的治療所造成的骨內感染，就是醫源性骨髓炎。