內窺鏡檢查：可直接看到膽汁返流，胃粘膜充血、水腫、或呈糜爛。活組織檢查提示胃炎。膽汁返流雖是胃切除術後常見的情況，如胃鏡檢查顯示萎縮性胃炎，膽汁返流性胃炎可以確診。
胃吸出物測定：插胃管後，抽吸空腹和餐後胃液，測定其中膽酸含量，如空腹基礎胃酸分泌量（BAO）<3．5mmol/h，膽酸超過30靏/ml， 則可確診膽汁返流性胃炎。
同位素測定：靜脈注射2mCi99mTc-丁亞胺雙醋酸，每隔5分鐘觀察肝及膽道共1小時。1小時病人員飲100ml水，內含0．3mCi99mTc，以準確測定胃的位置。隨後在2小時內，每15分鐘檢查肝、膽囊及胃區，決定腸胃返流指數。正常值為8．6±6．0；有返流性胃炎者增至86．3±7．1。也可用99mTc標記的溶液注入十二指腸或空腸上段，然後描記胃內同位素的含量，用以瞭解腸胃返流的程度。