網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法?

網絡藥理學預測化合物靶點,有很多免費的在線網站,本文介紹HTDocking方法預測化合物靶點,希望給做網絡藥理學方面的科研工作者帶來啟發。

工具/原料

能聯網的電腦

HTDocking數據庫賬號

方法/步驟

首先打開該數據庫網站(百度搜索即可),註冊賬號,然後登陸。

網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法

登錄之後,找到“Tools”,再找到Online GPCRDocking 然後點擊。

網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法

彈出如下結構式繪製(或上傳)的頁面,在這裡可以繪製或者上傳需要預測的化合物結構式。這裡選擇上傳化合物的結構式(格式為mol2),然後點擊search.

網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法

彈出化合物的預測頁面,等待預測完成,大約十幾分鍾。

網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法

全部預測完成後,會根據Docking Score的大小自動排列,根據需要選擇前10或者前20個靶點,點擊左側的鏈接。

網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法

彈出頁面中,找到“Gene Names”對應的基因名,複製保存起來。每個靶點都這樣操作後,整合起來就是預測的該化合物的靶點。

網絡藥理學預測化合物靶點——HTDocking方法

注意事項

本文僅展示化合物靶點預測的方法,後面如需作圖請參看其它教程。

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