這一次，我們的主角成為了這位綠頭髮的假面男，玩過SC的朋友們應該已經猜到他是誰了。離開宴會大廳，把走廊兩側的房間裡面的寶箱都搜刮一遍，這些初始資源將可能為接下來的戰鬥提供巨大的幫助。走廊左側第一個房間書架的角落可以讀到小說《紅耀石》。離開走廊之後經過甲板走到另一側，進入之後一段劇情，開始調查房間。該房間內有五處機關，調查並按下地毯左角、盆栽、花瓶和桌子這四處即可開啟隱蔽門，沙發下的機關一旦按下將會把所有已開啟的機關清零，就要重新按下了。
按下機關後調查隱藏門旁邊，選擇輸入第二組密碼（這個密碼其實來自SC終章），之後發生劇情，綠頭髮男子顯露自己的真實身份——星杯騎士凱文·格拉漢姆。劇情戰難度很低，凱文具有壓倒性的實力，只需要不斷地物理攻擊就能輕易擊敗。戰鬥後沿著來時的路返回宴會廳，路上會發生多次劇情戰，對手戰鬥力不高，凱文只需要不斷地物理攻擊，偶爾使用幾次死亡制裁就能輕易擊敗對手，進入走廊後用魔法回滿HP，走到盡頭又是劇情戰，敵方戰鬥力略有提升，只需要多用死亡制裁和物理攻擊結合，瞄準一兩個對手集中攻擊就能獲勝了。戰鬥後又是劇情，凱文離開飛行船，來到一艘國際定期船上。
現在還只能進入南街區和北街區，按地圖把所有的寶箱收集好（有一些重要的迴路和裝備），調查一下月之門2和太陽之門②（現在還都進不去），調查一下南街區的石碑（今後每當地圖中出現新的石碑和門請儘快調查，我就不再提示了），接著就向北進發，調查完星之門①之後到了王城門口，跟門口的魔獸戰鬥（此戰敵人數量較多，攻擊力很高，建議開場放S技秒殺周圍的小怪，之後集中精力打中間的鋼槍王者，也可以用提妲的煙幕彈把周圍小怪致盲之後逐個殲滅）。戰鬥後南街區通往東街區的結界解除。
在東街區進入帝國大使館就會進入強制戰鬥，敵人會蓄力之後釋放有即死效果的“朧”，一定要打斷。戰鬥後獲得新的封印石，將附近的寶箱收集好之後回到據點解封，穆拉加入，北街區通往東街區、西街區的結界解除。如果是PC版的玩家，這是穆拉第一次成為可控角色，穆拉擁有著全隊數一數二的物理攻擊力，平時依靠普通的物理攻擊就能造成巨大的傷害。穆拉加入之後，編隊系統開啟，援護系統開啟，在據點裡面點選螢幕左上角就能進行編隊了。同時星之門①可以進入了，把穆拉和尤利婭編入隊伍就能進入星之門①了。PSP玩家注意，在PSP版中尤利婭和穆拉的戰鬥力有了不小的提升，主要是戰技消耗CP變少，硬直時間變短，效果增強等等。
第三話 金之道 銀之道
☆本話開始之後一直到開始分組，都可以在大樹下的書庫內獲得利貝爾通訊02年前期~02年中期（FC部分）☆
本話開始時自動解放封印石，利貝爾王國王太女科洛蒂婭公主加入。科洛絲擁有很強的回覆力和魔法攻擊力，S技“光明之環”更是面臨團滅的時刻起死回生的保障，因此請在大多數時間把光明之環設為常駐S技。另一個S技“聖星光旋”不再是SC時的雞肋技能了，在3rd中傷害值與ATS掛鉤，在中前期是傷害值最高的S技，如果遇到了天使羊波波，聖星光旋更是能秒殺天使羊的神技。科洛絲加入之後就可以進入【星之門③】了。
【星之門③】主角是約修亞和科洛絲，人物可控後與所有人員對話，會知道SC結束後各位相關人員的活動，之後走到地圖中間的地方觸發劇情即可。獎勵3500mira和大盤料理雅餐“喜悅”。
從第二話BOSS戰結束的地方出現的傳送陣就會進入第三話的主迷宮——金之道銀之道了。第三話的入口處會進行分兵，凱文和莉絲分別帶領三個人走金之道與銀之道，兩條道路的敵人難度差別不大，因此本次分兵主要任務是兩支隊伍戰鬥力的均衡。兩條道路都會面對戰鬥力相當強悍的BOSS，所以兩隊都至少有一個要會使用“中回覆術·復”的隊員進行專職回覆。此時如果有等級過低的隊員的話，請去王都練級，由於空軌3rd對於低階打高階有經驗獎勵加成，所以等級較低的隊友也很容易把等級升上來。金之道與銀之道的隊員裝備、迴路都是共有的，一條道結束戰鬥之後把裝備迴路卸下之後就能讓另一支隊伍使用了，因此把好的裝備和迴路都交給其中一支隊伍吧。（另一支隊伍也不要什麼都不帶，剛進入路上的時候會直接發生劇情戰，難度不大，但是什麼都不帶的話就會陷入困境。。。）
準備好之後就去第三話的石碑處選擇“開始攻略”，之後凱文帶隊進入金之道，莉絲帶隊進入銀之道。選擇之前帶有好裝備的那支隊伍先攻略。為了方便敘述，我們先介紹金之道。
金之道路上小怪會用一種特殊的攻擊方式“魔術錘擊”，有可能是我方隊員身體膨脹，膨脹後攻擊力和速度大幅下降。路上不要忘了調查星之門④。終點處面對BOSS戰？莉絲？。此戰主BOSS？莉絲？並不顯眼，她帶來的四個小BOSS才是重點，戰場右側兩個藍色鏡子可以反射物理攻擊，左側兩個紅色鏡子可以反射魔法攻擊。建議先用魔法攻擊消滅藍色魔鏡，再用連鎖戰技或者S技消滅另兩個魔鏡，四個鏡子消滅後剩下的？莉絲？就沒有太大的威脅了。注意打倒之後她會變成擬態莉絲，再打倒之後變成格利摩爾（今後遇到的擬態我方人物基本都是這樣的，需要打倒三次才能獲勝= =）。這邊勝利之後不要著急前進，馬上把裝備迴路都卸下來供銀之道的小組使用。
銀之道路上的敵人會用自爆和即死攻擊，一定要小心。不要忘了調查月之門③。終點處有石碑，準備好之後前進開始BOSS戰。BOSS凱文開場會使用滿CP的星杯領域，敵方全員上雙層牆。本次BOSS戰建議用暗改法：請翻閱星杯手冊並給一名角色配出魔法“暗物質改”，該魔法具有將敵人吸引到魔法中心的附加效果，該效果用牆擋不住。同時如果造成傷害了還會有降低MOV的附加效果。所以開場以後那名角色一直放暗物質改，其他角色用其他的範圍魔法一起破牆，只要能夠全員破牆後再用一次暗物質改將敵方全體吸到後面並附加MOV DOWN狀態，敵方的就基本打不到我我方了= =戰鬥後繼續前進與凱文組會合。
解開第三話獲得的兩個封印石，金和奧利維爾加入。金叔擁有目前全隊最高的HP與防禦力，喜歡肉搏的玩家可以考慮；奧利維爾是一名很搞笑的角色，這次還有“閨蜜”穆拉在場，會給玩家帶來很多樂趣，而且此人的魔法能力同樣十分優秀。此時又有兩個門能夠進入了。
【星之門④】主角是金，進去之後看劇情即可。獎勵4000mira和迴路陰陽。這個迴路玩過SC的都會知道應該給科洛絲使用。
【太陽之門③ 裡·武術大會】（普通難度）帶著金就能進入了，現在只能參加普通難度作戰，是三連戰，難度對於此時我方有點大，感覺難度過大的可以以後再來。第三戰對手基爾巴特擊敗後掉落小丑徽章，該徽章可以通過不斷挑戰該戰鬥無限刷獲得，比較明顯的優勢是增加的SPD很多。戰鬥勝利後獲得5000mira和身之理（迴路，裝備者受到的物理攻擊傷害減少，魔法攻擊傷害增加）。這個門今後獲得了新的道具後可以挑戰更高的難度。
現在去第三話會合地點找寶箱，就會得到“插班考試合格證書”，讓科洛絲入隊，就能進入月之門③了。
【月之門③】主角科洛絲，劇情中的任務就是不斷的找人。第一次到社會系教室、禮堂舞臺左側廳、男子宿舍一層、舊校舍門口發資料；接著去社團大樓女子衣帽間；去禮堂2F；去校長辦公室辦理通行證之後出校門；去主樓門前；控制喬兒去宿舍二樓，劇情選項隨便選；控制科洛絲去禮堂右側房間、男生宿舍、社團大樓學生會辦公室調查窗子即可完成劇情。