用Past軟體做主成分分析(PCA)?

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主成分分析(PCA)是排序分析(Ordination)的一種,常用於生態學領域。本文介紹如何用Past做主成分分析

工具/原料

Past軟體

方法/步驟

Past資料匯入及樣品分組方法見《Past統計分析軟體資料匯入及分組方法》,最終得到如圖所示的資料形式。

首先Ctrl+A全選資料

0 Past統計分析軟體資料匯入及分組方法

用Past軟體做主成分分析(PCA)

Multivariate選單--Ordination--Principle Components (PCA)

用Past軟體做主成分分析(PCA)

Summary選項卡列出了每個座標軸的Eigenvalue值及其所佔百分比。

如果修改了執行引數,需要點選Recompute重新計算

用Past軟體做主成分分析(PCA)

Scatter Plot選項卡給出了PCA圖,右邊有若干選項(例如是否顯示樣品標籤)

點選“Graph Setting”按鈕可設定更多作圖選項

用Past軟體做主成分分析(PCA)

如圖可增加圖片的外邊框,將座標軸由中間位置改為在邊框上。

可選擇多種圖片格式(SVG是向量圖,最清晰),點選Picture按鈕可儲存圖片。

用Past軟體做主成分分析(PCA)

Scores選項卡顯示樣品點在PCA圖上的座標,點選Copy複製全部內容,可貼上到excel中。

用Past軟體做主成分分析(PCA)

注意事項

本經驗適用於Past 3.x,低版本Past的操作介面略有不同

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