小RNA是一類內源性的具有調控功能的非編碼RNA，主要包括miRNA、piRNA和siRNA等；它的功能主要是誘導基因沉默，參與基因轉錄後調控，在發育、病毒防禦、造血過程、器官形成、細抱增殖和凋亡等環節起著重要調控作用。
小RNA測序目標：
1. miRNA長度，莖環結構，miRNA前體加工，靶基因結合位點和預測；
2. 轉錄組和小RNA資料的聯合分析。
工具/原料
高通量測序平臺：Hiseq等
生物資訊學分析
方法/步驟
一、技術流程
二、生物資訊學分析內容
1. 測序質量分析與統計、評估；
2. microRNA，rRNA，tRNA，intron，exon，snRNA，snoRNA註釋；
3. microRNA的表達量差異分析；
4. microRNA表達模式聚類分析；
5. microRNA保守性分析；
6. microRNA與靶基因之間的調控， microRNA靶基因之間的蛋白-蛋白相互作用網路分析；
7. 靶基因預測；
8. 新miRNA預測。
三、結果展示
1. 資料庫使用
2. 版圖展示
四、樣本要求
總量：〉4 µg RNA；濃度：〉50 ng/µL